En juin 2008, le Secrétaire Général des Nations Unies a déclaré l’Union des Comores éligible au FCP avec une enveloppe de 9 millions de dollars sur 30 mois de 2009 à 2011. Des consultations ont eu lieu pour établir un plan prioritaire avec les autorités comoriennes, les partenaires au développement, la société civile et le secteur privé. Ainsi, la consolidation de la paix s’inscrit dans le cadre plus large d’un programme post conflit intégré et cohérent. En effet, ce programme comprend plusieurs autres initiatives, dont celles relatives à la sécurité humaine, à la cohésion sociale, à la sécurité alimentaire, ou encore au plan d’assistance pour le redressement et la stabilisation.
Un Comité de pilotage, présidé par le Vice-président Chargé du Ministère des Finances, du Budget et de l’Entreprenariat Féminin et le Coordonnateur Résident du Système des Nations Unies, veille au bon fonctionnement du FCP. Le Gouvernement de l’Union des Comores et l’Équipe Pays se sont mis d’accord pour que les Comores tirent profit de ce programme afin de faire avancer la réforme « Unis dans l’action ». Le FCP offre donc un complément de réponse catalyseur et essentiel à la construction d’une approche adaptée et intégrée des différents programmes des Nations Unies.
